Mokslininkai nustato Aye-Aye genomą | Biologija

Mokslininkai nustato Aye-Aye genomą |  Biologija

Tarptautinė genetinių tyrėjų komanda suskirstė ir išanalizavo trijų atskirų aye-ay populiacijų genomus.Daubentonia madagascariensis), lemūrų rūšis, aptinkama tik Madagaskaro saloje.

Aye-aye turi ilgą, ploną ir lankstų vidurinį pirštą, leidžiantį iš medžių išgauti vabzdžių lervas ir užpildyti ekologinę genių nišą (Edward Louis / Omaha zoologijos sodas)

„Aye-aye yra vienas neįprastiausių ir žaviausių gyvūnų pasaulyje“, – sakė profesorius George’as Perry iš Penn State universiteto, pagrindinio straipsnio, kuriame pateikiami genomo sekos analizės rezultatai. Proceedings of the National Academy of Sciences.

„Aye-ayes nuolat augančiais smilkiniais įgraužia negyvų medžių žievę, o po to ilgu, plonu ir lanksčiu viduriniu pirštu ištraukia vabzdžių lervas, užpildančias ekologinę genių nišą. Aye-ay yra naktiniai, pavieniai ir jų populiacijos tankis labai mažas, todėl juos sunku tirti ir paimti gamtoje.

Prof. Perry pridūrė, kad jis ir kiti mokslininkai yra susirūpinę dėl ilgalaikio „aye-ayes“ kaip rūšies gyvybingumo, atsižvelgiant į natūralių Madagaskaro miško buveinių nykimą ir susiskaidymą.

„Aye-aye gyventojų tankis yra labai mažas, o pavieniams aye-ay’ams keliami didžiuliai namų arealo reikalavimai. Miško lopams mažėjant, kyla ypatinga rizika, kad tam tikroje vietovėje nebus pakankamai pavienių tvarsčių, kad būtų išlaikyta populiacija per kelias kartas. Siekėme pasinaudoti naujomis genomo sekos nustatymo technologijomis, kad apibūdintume kai kurių išlikusių populiacijų genetinės įvairovės modelius, atsižvelgiant į išsaugojimo pastangų prioritetą.

Mokslininkai stengėsi surasti „aye-ay“ ir surinkti DNR mėginius iš trijų atskirų Madagaskaro regionų: šiaurinio, rytinio ir vakarinio regionų. Norėdami išsiaiškinti genetinės įvairovės mastą dabartiniuose „aye-ay“, jie sukūrė visas 12 atskirų „aye-ay“ genomo sekas. Tada jie išanalizavo ir palygino trijų populiacijų genomus.

Jie nustatė, kad nors rytinės ir vakarinės aye-ay yra šiek tiek genetiškai skirtingos, šiaurinėje salos dalyje ir rytinėje salos dalyje yra daug didesnis genetinis atstumas, o tai rodo ilgą laikotarpį, per kurį kryžminamasi. tarp šių regionų populiacijų nebuvo.

Aye-ay šiaurinėje Madagaskaro salos dalyje rodomas didelis genetinis atstumas nuo populiacijų rytuose ir vakaruose, o tai rodo ilgą laiko tarpą, per kurį šiaurinės aye-ayes nesikryžmina su kitomis populiacijomis (Edward Louis / Omahos zoologijos sodas)

Aye-ay šiaurinėje Madagaskaro salos dalyje rodomas didelis genetinis atstumas nuo populiacijų rytuose ir vakaruose, o tai rodo ilgą laiko tarpą, per kurį šiaurinės aye-ayes nesikryžmina su kitomis populiacijomis (Edward Louis / Omahos zoologijos sodas)

„Kitas mūsų žingsnis buvo palyginti aye-aye genetinę įvairovę su dabartine žmogaus genetine įvairove“, – sakė profesorius Webbas Milleris, taip pat iš Penn State universiteto. „Ši analizė gali padėti mums įvertinti, kiek laiko „aye-aye“ populiacijos buvo geografiškai atskirtos ir negalėjo susikryžminti.

Palyginimui komanda surinko 12 pilnų žmogaus DNR sekų – tiek pat kiek ir sukurtų atskirų „aye-aye“ sekų – iš viešai prieinamų duomenų bazių, skirtų trims skirtingoms žmonių populiacijoms: Afrikos žemdirbiams, europiečių kilmės asmenims ir Pietryčių Azijos individams. Naudodama Galaxy – atviro kodo žiniatinklio kompiuterių platformą, sukurtą Peno valstijoje daug duomenų reikalaujantiems biomedicininiams ir genetiniams tyrimams – komanda sukūrė programinę įrangą, leidžiančią palyginti dviejų rūšių genetinius atstumus. Jie nustatė, kad dabartinės Afrikos ir Europos žmonių populiacijos turi mažesnį genetinį atstumą, nei nustatyta tarp šiaurinių ir rytinių aye-aye populiacijų, o tai rodo, kad aye-aye populiacijos ypač ilgą laiką buvo atskirtos pagal geografinę padėtį. kliūtis.

„Manome, kad šiaurinės aye-ayes jau kurį laiką negalėjo kryžmintis su kitomis populiacijomis. Nors juos skiria tik maždaug 160 mylių atstumas, aukštos ir didelės plynaukštės ir pagrindinės upės galėjo susimaišyti gana retai “, – sakė profesorius Milleris. „Komandos duomenų rezultatai taip pat rodo, kad dviejų „aye-aye“ populiacijų atsiskyrimas tęsiasi daug ilgiau nei 2300 metų, kai į salą pirmą kartą atvyko žmonės, kurie pradėjo deginti „aye-aye“ miško buveinę ir medžioti lemūrus. .

______

Bibliografinė informacija: George H. Perry ir kt. „Aye-aye“ populiacijos genominės analizės išryškina svarbų endemizmo centrą šiaurės Madagaskare. PNAS, paskelbtas internete prieš spausdinimą 2013 m. kovo 25 d.; doi: 10.1073 / pnas.1211990110

Leave a Comment

Your email address will not be published. Required fields are marked *